各組研究
本系教學與研究概分為七大領域：流體力學與空氣動力學、燃燒 / 熱傳與噴射推進、結構與材料、導航與控制、民航技術、太空科技、微奈米機電等；未來並加強跨領域之合作發展，使學生具備深入之科技專業與廣闊之尖端知識，除傳統之飛機及衛星科技外，亦朝微飛機及微衛星的系統發展，引領我國航太科技橫跨巨觀及微觀雙世界。
本系在研發上注重軍民通用科技之配合，鼓勵教授進行跨專長之合作計畫，如無人載具之飛機研製、氣渦輪引擎技術以及飛機維護等整合型之研究計劃；積極參與國家太空計畫室之衛星計畫，以及推動微機電與民航領域的研究；自九十一年起加入由丁肇中院士所主持之「反物質探索研究」團隊，在跨領域的研究上更跨出了一大步。
本系研究教學上強調基本工程學（如熱力、流力、熱傳、結構、材料、電子、控制等）與航太工程學（如空氣動力學、氣體動力學、航空發動機、飛行力學、飛具設計、太空力學等）並重，兩個研究所之研究領域概要分述如下：
航太所研究領域
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流體與空氣動力學 本領域之研究方向著重於：
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燃燒、熱傳與噴射推進 本領域之研究方向著重於 ：
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結構與材料 本領域之研究重點方向包括：
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導航與控制 本領域之研究重點方向包括：
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太空系統工程 目前之研究方向:
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跨領域研究 為因應國家奈米技術發展，本系集合流力、結構、熱燃、控制等專家並聘請教授共同組成微機電系統 ( MEMS ) 跨領域研究團隊。 研究課題包括:
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民航所研究領域
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機務維修與系統品保 主要研究方向包括：
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營運規劃與飛航管理 主要研究方向包括：
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飛航安全與人為因素 主要研究方向包括：
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飛航之導航及通訊研究 主要研究方向包括：
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